- สำนักงานเลขานุการกรม
- กองการเงินและบัญชี
- กองกฎหมายและที่ดิน
- กองแผนงาน
- กองพัสดุ
- ศูนย์สารสนเทศ
- สำนักเครื่องจักรกล
- สำนักบริหารโครงการ
- สำนักพัฒนาโครงสร้าง
- สำนักวิจัยและพัฒนา
- สำนักสำรวจด้านวิศวกรรมฯ
- สำนักออกแบบวิศวกรรมฯ
- สำนักอุทกวิทยาและบริหารน้ำ
- สำนักโครงการขนาดใหญ่
- สำนักงานจัดรูปที่ดิน
- กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร
- กลุ่มตรวจสอบภายใน
- กลุ่มกิจกรรมพิเศษ
- สชป.1 (เชียงใหม่)
- สชป.2 (ลำปาง)
- สชป.3 (พิษณุโลก)
- สชป.4 (กำแพงเพชร)
- สชป.5 (อุดรธานี)
- สชป.6 (ขอนแก่น)
- สชป.7 (อุบลราชธานี)
- สชป.8 (นครราชสีมา)
- สชป.9 (ชลบุรี)
- สชป.10 (ลพบุรี)
- สชป.11 (นนทบุรี)
- สชป.12 (ชัยนาท)
- สชป.13 (กาญจนบุรี)
- สชป.14 (ประจวบคีรีขันธ์)
- สชป.15 (นครศรีธรรมราช)
- สชป.16 (สงขลา)
- สชป.17 (นราธิวาส)
- สถาบันพัฒนาการชลประทาน